2ページを合わせて1ファイルとして作成して、そのまま入稿しても大丈夫です。その際は「004-005.psd」など、2ページ分であることがわかるようなファイル名にしてください。塗り足し部分は上、下、左、右のそれぞれに3mm作成してください(真ん中部分の塗り足し部分は考えなくて大丈夫です)。
背幅0mmの表紙用テンプレートを見開きに流用しても大丈夫です。